La Facultad de Odontología de la UADY se encuentra ubicada en la calle 61A x 90 y 92 de la ciudad de Mérida, Yucatán al costado sur del Parque de la Paz, quedando en el segundo cuadro de la ciudad en su lado poniente.
Por su ubicación es de fácil acceso tanto por vehículos particulares como por transporte público, ya que se encuentra en un área que alberga diferentes edificios del área de la salud donde convergen muchas de las principales vialidades, entre las más conocidas están la avenida Itzaés y la calle 59.
Como puntos de referencias rápido pueden nombrarse: La ex-penitenciaría “Benito Juárez”, el Parque Zoológico del Centenario, El Hospital Militar Regional de Especialidades, El Centro Regional de Investigaciones “Hideyo Noguchi” y el Hospital General “Agustín O’Horan”
